事例紹介

学校法人の消費税区分是正とインボイス運用の整備

関東圏 学校法人

ご相談の背景

収益事業に係る消費税区分が不統一で、仕入税額控除の適用可否や按分計算に不安。インボイスの受領・保存実務も部門ごとにばらつきがあり、監査・調査での指摘リスクが懸念されていました。

実施した対応

  • 区分マッピング:収益/非収益、課税/非課税/不課税の区分表を再設計。部門別の取引実態を棚卸。
  • 按分ルールの明文化:課税売上割合・共通仕入の按分方法を文書化し、期中運用に落とし込み。
  • インボイス実務:受領・保存・検索要件のフローを統一。ベンダー別チェックリストを導入。
  • ダッシュボード:月次で区分エラーと未対応インボイスを可視化、是正期限を管理。

結果

区分誤りの再発が大幅に減少し、仕入税額控除の適用漏れも解消。監査での指摘はゼロ、税務調査においても 区分・按分の根拠が明確なため追徴リスクを実質的に低減できました。

ポイント

  • 「名称」ではなく「実態」で区分——教育/収益の境界整理が重要。
  • インボイスは受領・保存・検索の3要件を運用フローに埋め込む。
  • 属人的判断を排し、ドキュメント化で運用の再現性を確保。
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